Каргопольский район имеет статус муниципального образования.                        

Структуру органов местного самоуправления муниципального образования «Каргопольский муниципальный район» образуют:

- представительный орган МО «Каргопольский муниципальный район» - Собрание депутатов муниципального образования «Каргопольский муниципальный район»;

- глава муниципального образования «Каргопольский муниципальный район»;

- исполнительно – распорядительный орган МО «Каргопольский муниципальный район» - администрация муниципального образования «Каргопольский муниципальный район».

На территории МО «Каргопольский муниципальный район» в соответствии с законом Архангельской области от 23.09.2004 года № 258-внеоч-ОЗ образованы городское поселение МО «Каргопольское» и 5 сельских поселений: МО «Ошевенское», МО «Павловское», МО «Печниковское», МО «Приозерное», МО «Ухотское».